在实验室里工作的涅被像死神剧场版3：黑色褪去 呼唤君之名在线观看镰刀一样的东西袭击，身体产生了异变。 
　　涅突然像疯了似的，没有缘由地乱敲试验装置的操作盘。 
　　於是，一瞬间瀞灵廷被灵子云所覆盖，死神们都准备去联络涅。 
　　当剑八冲进涅的实验室时，发生了巨大的灵子爆炸。 然后，瀞灵廷被破坏了。 
　　露琪亚惊愕地在远处发现了瀞灵廷被破坏，在她面前出现了某个影子。 
　　那个影子向露琪亚斩下镰刀，露琪亚的身体（心）之中像是有什麼东西消失了…… 
　　同时，现世中感觉到异变的一护去找浦原。一护从浦原那裏听到了「瀞灵廷被破坏」的消息，便和魂一同去尸魂界。 
　　在崩坏的净灵廷中等待著一护的，是消除了和一护相关记忆的恋次等人。不仅仅是一护的事情，连露琪亚的事情都消失了。 
　　在死神面前虚化的一护，被当成了破坏净灵廷的犯人追杀……。 
　　尸魂界里到底发生了什麼？ 
　　谜之两个黑影的真实身份是？ 
　　露琪亚去了哪里？ 
　　一护孤独的战斗开始了……。